Nowa mutacja wirusa w Nigerii

W African Centre of Excellence for Genomics of Infectious Diseases (https://www.ace.edu.ng/ace/centres/acegid/ na Redeemer University w Nigerii zidentyfikowano dwie sekwencje SARS-CoV-2, które mają dotychczas nieopisywaną mutację w białku kolczastym. Mutacje zostały wykryte w dwóch próbkach pobranych 3 sierpnia i 9 października 2020 roku od osób z stanu Osun w Nigerii.

Location Nigeria AU Africa 400

Pierwszy autor doniesienia, John N. Nkengasong jest kameruńskim wirusologiem i dyrektorem Africa Centres for Disease Control and Prevention. Wcześniej pracował w WHO oraz w CDC. Podczas pandemii COVID-19 John N. Nkengasong został mianowany specjalnym wysłannikiem WHO na Afrykę.

Africa CDC Director Dr. John Nkengasong 37892303376 400

Dr John Nkengasong

Badacze piszą, że nie ma dowodów wskazujących na to, że opisany przez nich wariant P681H przyczynia się do zwiększonego przenoszenia wirusa w Nigerii. Obecnie są w trakcie sekwencjonowania większej liczby próbek pobranych podczas ostatniego wzrostu liczby przypadków COVID-19 w Nigerii. Jak dotychczas stwierdzono, że tylko około 1% próbek ma typ B.1.1.7 koronawirusa, który jest przyczyną wzrostu zachorowań w Wielkiej Brytanii. Inne zgłaszane mutacje, takie jak N501Y, A570D i HV 69-70 nie zostały jak na razie wykryte w Nigerii.

Pełny efekt tej mutacji nie jest jeszcze znany i nadal jest badany, dlatego bardzo ważny jest system nadzoru genomowego. Z nigeryjskimi sekwencjami SARS_CoV_2 uzyskanymi od początku pandemii w Nigerii można zapoznać się na stronie https://virological.org/t/detection-of-sars-cov-2-p681h-spike-protein-variant-in-nigeria/567 oraz na stronie GISAID (https://www.gisaid.org/) – jest to placówka zajmująca się badaniami genomu poszczególnych wirusów, zwłaszcza grypy H1N1, H7N9 oraz ostatnio COVID-19. (K.K.)

GISAID NGS Workshop in Paris 2015 660

Zespół badaczy GISAID

Źródło: https://virological.org/t/detection-of-sars-cov-2-p681h-spike-protein-variant-in-nigeria/567  

Źródła ilustracji

https://en.wikipedia.org/wiki/John_Nkengasong#/media/File:Africa_CDC_Director_Dr._John_Nkengasong_(37892303376).jpg

https://pl.wikipedia.org/wiki/Osun#/media/Plik:Osun_State_Nigeria.png

https://pl.wikipedia.org/wiki/Nigeria#/media/Plik:Location_Nigeria_AU_Africa.svg

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/75/GISAID_NGS_Workshop_in_Paris_2015.jpg

GdL 1_2021